Il a été démontré que les peptides de collagène de poisson, comme ceux provenant de vaches ou de porcs, stimulent la production de collagène dans la peau. Bien que toutes ces sources soient efficaces, la recherche suggère que les peptides de collagène dérivés du poisson ont un niveau d'activité biologique plus élevé. La recherche a montré que les peptides de collagène dérivés du poisson sont nettement mieux absorbés, ce qui pourrait être la première raison de leur plus grande efficacité. D'autres raisons peuvent être liées à la variance des séquences d'acides aminés dans la peau de poisson, par rapport aux sources mammifères.
Outre l'efficacité, les différentes sources diffèrent dans la manière dont elles sont traitées. Les peaux épaisses de vaches et de porcs nécessitent 2 à 3 semaines de trempage dans un produit chimique acide ou alcalin pour décomposer le tissu. Les sources de poisson ne nécessitent aucun prétraitement et il faut environ 36 heures pour les transformer en poudre de peptide de collagène raffiné.
Les peptides d'origine bovine et porcine peuvent ne pas convenir à certaines populations en raison de croyances culturelles ou religieuses. Les sources de poisson sont généralement consommées sans restrictions de ce type.
Enfin, les peptides d'origine bovine et porcine ont une empreinte environnementale nettement plus élevée que ceux issus de la pêche sauvage, comme la pêche au cabillaud islandais. De plus, la pêche au cabillaud islandais est gérée de manière durable et considérée comme une référence en matière de pêche responsable.